Redan i slutet av 1800-talet skapades en sjökarta som visade på stora djuphålor i sjön som var över 221 meter djupa. Kartan hade dock brister. Bland annat var texten svårtolkad.[7] Den 16 mars 2023 visade SMHI:s kontrollmätning av Hornavans djupaste del att botten är plan och att maxdjupet ligger kring 210 meter. Det innebär dock att Hornavan fortfarande är Sveriges djupaste sjö.[7]
Hornavan ingår i delavrinningsområde (734935-157916) som SMHI kallar för Utloppet av Hornavan. Medelhöjden är 474 meter över havet och ytan är 642,49 kvadratkilometer. Räknas de 230 avrinningsområdena uppströms in blir den ackumulerade arean 4 207,93 kvadratkilometer. Avrinningsområdets utflöde Skellefteälven mynnar i havet.[5] Avrinningsområdet består mestadels av skog (53 procent). Avrinningsområdet har 265,42 kvadratkilometer vattenytor vilket ger det en sjöprocent på 41,3 procent.[4]